説明を分かりやすくするため、魔法を魔法処理での扱いによって3タイプに分けます。
魔法攻撃は以下の順に処理が行われます。
祈り・アイテム・装備品で発動する魔法と非純粋魔法は確実に発動します。 純粋魔法は以下の3つの判定を全て満たすときに発動します。
魔封じ状態であると、ディシャットを除く純粋魔法は無効になります。
相手側（対象ではない）に魔法無効化能力を持つ者がいると、1体につき1/32で魔法が発動できません。
例えば、魔法無効化敵が2体いると、味方の魔法発動率は(31/32)^2=94％となります。
ただし、ガイアーネ戦は魔法無効化されません。
LVを上回る魔法LVの魔法を使用した場合の成功率は3/4です。
また、スキュラ戦以前のルフィーアがフレイムを使用する場合は以下のようになります。
魔法攻撃のダメージは以下の通りです。
［攻撃魔力×威力×耐性値×4/｛知恵＋（0〜3）×（DLV＋8）/8｝］/4
※攻撃魔力×威力×耐性値×4の最大値は65535です。
※ダメージの最大値は9999です。
※浮遊している場合、アースクェイクと地獄の釜のダメージは0になります。
※耐性値が吸の場合は耐性値＝15とし、反の場合は耐性値＝14として計算します。
※威力×耐性値はmod256です。
ダークボールがある場合、純粋魔法を全て無効化します。
魔法を無効化した場合、1/4でダークボールは消滅します。
結果は命中、無効、反射、吸収に分かれます。
それ以外の魔法は以下の式を満たす場合に命中となり、満たさない場合は無効となります。
｛（攻撃魔力/2＋魔法命中×2）×8＋（0〜15）×（DLV＋8）｝×耐性値≧｛知恵×8＋（0〜15）×（DLV＋8）｝×4
※魔法命中が0の魔法と対象が味方の魔法は、ディーマで無効にされる場合を除いて必ず命中となります。
反射は耐性反射とミラージオ反射に分かれます。
耐性反射は純粋魔法と祈る・アイテム・装備品の魔法を反射できます。
ミラージオ反射は命中した純粋魔法と祈る、破魔の杖までの装備品の魔法を反射できます。
ミラージオ反射がダメージをそのまま反射するのに対し、
耐性反射は ダメージ＝ダメージ/4（最小値は1） となります。
耐性でもミラージオでも反射できる場合は、耐性反射が優先されます。
魔法を反射した場合、魔法使用者がミラージオ状態であれば魔法は再び反射できて無効化されます。
魔法使用者が反射できない場合はバリアー・幽霊草判定を経ずに使用者に命中します。
反射された魔法で状態異常になることはありません。
ミラージオで魔法を反射した場合、1/4でミラージオは消滅します。
魔法を吸収する場合はミラージオを使うことはありません。ダメージがそのまま回復量になります。
バリアーは命中し、反射されなかった非純粋魔法とアイテム、 マッドネス以降の装備品の魔法をダメージそのままで反射できます。 反射された魔法で状態異常になることはありません。 物理攻撃に対しては命中判定を行う前に耐久を消費して無効化します。
幽霊草は命中し、反射されなかった非純粋魔法とアイテム、 マッドネス以降の装備品の魔法を無効化できます。 物理攻撃に対しては命中判定を行う前に耐久を消費して無効化します。
耐久が両方とも残っている場合は、バリアーを優先して消費します。 バリアーは魔法攻撃のダメージを反射できる点、幽霊草はダークボールで無効化されない点が有利です。
バーサークも無効化されるので、使用する場合は注意が必要です。
幽霊草の耐久が0になっても、物理攻撃でダメージを受けたり、
魔法の対象になったりするまでグラフィックが元に戻らない点も注意が必要です。
威力が0の魔法は命中すれば状態異常にできます。 威力が1以上の魔法は、魔法が命中してかつ以下の判定を満たす場合に状態異常にします。 ｛ ｝は小数第一位四捨五入を表します。
ダメージ×4/知恵＞｛DLV/8｝＋（0〜7）
耐性値は敵ごとに決まっており、27種類のグループに分けることができます。
以下がグループごとの耐性値を表した表です。なお、常にマイト系魔法（古属性）の耐性値は6です。
| 火 | 水 | 風 | 地 | 心 | 魔 | 生 | 呪 | 該当敵 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (0) | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 0 | 4 | シーフ系、オーク・魔戦士・魔導士種 |
| (1) | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 4 | 0 | 4 | バット・鎧獣・獅子・飛獣・伏獣・魔熊・魔犬・魔狼・妖馬・大蛇・甲殻獣・巨大蛸種 |
| (2) | 吸 | 7 | 1 | 2 | 3 | 4 | 0 | 2 | ドラゴンマン、ドラゴンカブ、サラマンダー、マグマン他 |
| (3) | 1 | 2 | 6 | 2 | 3 | 4 | 0 | 2 | 水人種、ナアス、ウンディーネ |
| (4) | 4 | 6 | 吸 | 4 | 3 | 4 | 0 | 2 | 鳥人・妖精鳥種、ジニー、エキシム、シルフ |
| (5) | 2 | 6 | 2 | 吸 | 3 | 4 | 0 | 2 | ナーガ、マブ |
| (6) | 10 | 反 | 2 | 2 | 3 | 4 | 0 | 2 | トロル種、ドラゴネット、フリーザー、セルヴァン |
| (7) | 6 | 2 | 1 | 2 | 0 | 4 | 10 | 0 | 亡霊・スケルトン・ゾンビ種、モーラ、レイス |
| (8) | 7 | 6 | 5 | 1 | 0 | 3 | 4 | 0 | スライム・スライム人種、マッドウォリアー |
| (9) | 3 | 3 | 3 | 4 | 0 | 3 | 4 | 0 | ゴーレム・石像・ミミック・邪神種、リビングアーマー、デスアーマー |
| (11) | 反 | 反 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | ディアモンテ、ネクロマンサ、ジェヌーン、パジョー他 |
| (12) | 6 | 6 | 6 | 6 | 6 | 2 | 0 | 1 | ピクシー、リッチ、シャドウ |
| (13) | 6 | 7 | 6 | 4 | 3 | 3 | 0 | 3 | 巨大蟹・巨大蠍・巨大虫・毒蜂・妖花種、フィーシルブ |
| (14) | 5 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 3 | 猫人・夜魔・狼人・爬虫人・虫女種、ワーベア他 |
| (15) | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 0 | 4 | 巨人・ニンフ・フェアリー・鬼火・怪樹種、アニス、ヴァンピー |
| (16) | 3 | 2 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | バンシー、デュラハーン、ファントム他 |
| (17) | 吸 | 反 | 3 | 4 | 1 | 0 | 0 | 0 | シャルローテ |
| (18) | 3 | 1 | 1 | 吸 | 0 | 0 | 0 | 0 | ミレンシェ |
| (19) | 3 | 1 | 吸 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | パリュ |
| (20) | 3 | 3 | 3 | 3 | 1 | 0 | 0 | 0 | ブラックドラゴン |
| (21) | 2 | 2 | 2 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | モンタズナ |
| (22) | 反 | 1 | 1 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | ディオシェリル |
| (23) | 4 | 3 | 3 | 3 | 2 | 0 | 0 | 0 | イフィーヌ、メナンドゥーサ |
| (24) | 3 | 2 | 2 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | ドローネ、ネフェルーダ |
| (25) | 3 | 0 | 吸 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | ガイアーネ頭 |
| (26) | 3 | 3 | 吸 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | ガイアーネ腕 |
| (27) | 3 | 反 | 吸 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | ガイアーネ胸 |